法律分析：
劳动合同在性质上属于合同、协议，既然是合同，那么必然是合同各方协商而订立，至少表面上劳动合同也是双方协商订立，而不是公司单方面制定。（实际上合同条款大部分都是公司定的，但是形式上是双方协议的。）而员工手册（规章制度）不是合同，而是公司单方面制定，只要内容合法，并且在制定的程序上征求了员工或者员工代表的意见，员工手册就可以适用。二且劳动合同是有法律效力的。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》
第四百六十五条 依法成立的合同，受法律保护。依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。
第四百六十六条 当事人对合同条款的理解有争议的，应当依据本法第一百四十二条第一款的规定，确定争议条款的含义。合同文本采用两种以上文字订立并约定具有同等效力的，对各文本使用的词句推定具有相同含义。各文本使用的词句不一致的，应当根据合同的相关条款、性质、目的以及诚信原则等予以解释。
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