农村自建房可以办理营业执照，但房屋应当符合国家建筑安全、安全生产及等要求，违法建筑、危房及其他不符合法律法规要求的房屋不能办理营业执照；
进行经营并不需要农业产权转商业产权，如果你想要把产权进行转移按法律规定是要办理转让手续并交纳费用，但是我国法律还有规定对农村的宅基地依法不得买卖，根据我国《土地管理法》与《土地管理法实施条例》对农民的宅基地权利有着如下的明确规定：宅基地只能在本集体组织成员之内转让，城镇居民购买宅基地的行为无效。
自建房没有房产证不可以办理营业执照。个人开店办理营业执照的需要以下材料：
1、本人身份证及复印件(外来人员另需要暂住证及复印件)。
2、经营场所的房屋租赁合同或者房产证及复印件。
3、本人一寸免冠彩色照片两张。
4、从事饮食、化妆品等特殊行业的还要准备健康证件等及复印件(涉及前置审批行业需提供审批意见)。因此自建房办理营业执照，需要的房子的房产证。房产证在开业登记、换照以及变更营业场所的变更登记中都需要。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》
第七条 依法设立的公司，由公司登记机关发给公司营业执照。公司营业执照签发日期为公司成立日期。公司营业执照应当载明公司的名称、住所、注册资本、经营范围、法定代表人姓名等事项。公司营业执照记载的事项发生变更的，公司应当依法办理变更登记，由公司登记机关换发营业执照。
《中华人民共和国公司登记管理条例》
第五十 《企业法人营业执照》、《营业执照》分为正本和副本，正本和副本具有同等法律效力。国家推行电子营业执照。电子营业执照与纸质营业执照具有同等法律效力。《企业法人营业执照》正本或者《营业执照》正本应当置于公司住所或者分公司营业场所的醒目位置。公司可以根据业务需要向公司登记机关申请核发营业执照若干副本。
