办理土地使用证是要收费的，只是收费标准和收费依据由各地自行制定，各地有所不同。
比如江苏省某地的标准：
1、土地登记费(苏价涉[1995]155号、苏价房[1999]134号)：
①党政机关、人民团体、全额预算管理事业单位每宗地收10元；
②企业、自收自支单位土地使用面积在1000m2(含1000m2)以下每宗地收110元，每超过500m2以内加收40元，最高不超过4万元；
③差额预算管理事业单位土地使用面积在2500m2(含2500m2)经下每宗地收160元，每超过500m2以内加收20元，最高不超过1万元；
④城镇私房用于生产经营地土地使用面积在500m2(含500m2)以下每宗地收90元，每超过100m2以内加收20元，最高不超过200元；
⑤城镇居民住房(私房)土地使用面积100m2(含100m2)以下每宗地收18元，每超过50m2以内加收5元，最高不超过35元。
另外对于民房遗留问题，根据淮政发[2003]131号文件：超法定面积135m2以上部分按90元/m2收取；
一、国有土地使用证办理流程
1、土地登记申请
(1)有关宗地来源的批复及批准文件，建设用地许可证。提交国有土地使用权通过招标、拍卖、协议等形式进行操作程序中有效性的相关土地权属材料。
(2)因买卖、继承、赠与等形式取得土地使用权的、提交买卖、继承、赠与土地使用权转让协议书和公证书，原土地使用的国有土地使用证书。
(3)提交土地登记申请人的身份证、户口薄。企事业单位的土地使用者应提交土地登记法人证明书和组织机构代码证、法人身份证。
2、地籍调查
对土地登记申请人的土地采取实地调查、核实、测量、绘制宗地草图及红线图。查清土地的位置、权属性质、界线、面积、用途及土地使用者的有关情况。并要求宗地四周邻居界线清楚，无争议，确认后签字盖章。
3、土地权属审核
土地登记机关对土地使用者提交的土地登记申请书、权属来源材料和地籍调查结果进行审核，决定对申请土地登记的使用者土地权属是否准予登记的法律程序。
4、颁发国有土地使用权证书。
有些人可能不清楚，在我国办理房产证，土地使用证，结婚证等这些国家行政单位出具的证件，其实都不是免费的。可是，国家行政单位、事业单位和普通企业办理土地使用证的时候，需要缴纳费用肯定是有差异的，一般来说和土地的面积、用途等这些有一定的关系。
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