两者的不同主要表现在犯罪的主观故意不同，集资诈骗罪是行为人采用虚构事实、隐瞒的方法意图永久非法占有社会不特定公众的资金，具有非法占有的主观故意；而非法吸收公众存款罪行为人只是临时占用投资人的资金，行为人承诺而且也意图还本付息。非法吸收公众存款罪量刑分为两档，最高刑罚为十年有期徒刑，个人：扰乱金融秩序（立案标准），处3年以下有期徒刑或拘役，并处或单处2万元以上20万元以下罚金； 数额巨大（100万元/100人/直接经济损失50万元以上）或者有其他严重情节的，处3年以上10年以下有期徒刑，并处5万元以上50万元以下罚金。
非法筹集的资金在案发前全部或者大部分没有归还，造成投资人重大经济损失，则定集资诈骗罪的可能性更大一些，如果非法筹集的资金在案发前全部或者大部分已经归还，则定集资诈骗罪的余地就非常小，一般应定非法吸收公众存款罪。
案发后行为人具有归还能力，并且积极筹集资金实际归还了全部或者大部分资金，则具有定非法吸收公众存款罪的可能性；如果案发后行为人没有归还能力，而且全部或者大部分资金没有实际归还，则具有定集资诈骗罪的可能性。
行为人具有下列情形之一的，应认定其行为属于使用诈骗方法非法集资：
1、集资后携带集资款潜逃的;
2、未将集资款按约定用途使用，而是擅自挥霍、滥用，致使集资款无法返还的;
3、使用集资款进行违法犯罪活动，致使集资款无法返还的;
4、向集资者允诺到期支付超过银行同期最高浮动利率50@0以上的高回报率的。
法律依据：
《中华人民共和国刑法》 第一百七十六条
非法吸收公众存款罪是指，非法吸收公众存款或者变相吸收公众存款，扰乱金融秩序的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处二万元以上二十万元以下罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。
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