医保卡余额为零的原因一般有；
1.医保机构还没有进行划账，如果参保人才刚刚拿到医保卡不久，查询余额时发现为零，可能是因为医保经办机构还没有正式划账，只需要耐心等待即可；
2.查询方式不正确，社保卡中一般是包含两个账户的，其中一个是银行卡账户，二者不通用，因此，如果是在ATM机进行余额查询的话，那么只能够查询到银行卡账户中的余额，如果没有使用过银行卡账户的话，那么余额自然会显示为零；
3.灵活就业人员按照最低档缴费是不设立医保个人账户的，因此余额为零；
4.城乡居民医保不设置医保个人账户，因此余额为零。
一、查询医保卡的方法
1.窗口查询:被保险人直接将有效身份证和社保卡带到个人社保机构窗口查询；
2.官网查询:进入社会劳动保障网，登录页面输入身份证号码后可直接查询；
3.手机查询:拨打12333服务电话，根据语音提示进行操作查询；
4、手机上APP查询：可下载本地医疗保险APP，按提示查询。
二、医保卡与社保卡的关系
医疗保险卡全名为医疗保险卡，由参加医疗保险的职工或居民就医。社会保障卡全称为社会保障卡，集医疗保险、养老保险、下岗等综合服务于一体。过去，被保险人缴纳个人社保后，会发放社保卡和医保卡，但很多地区只发放社保卡。的确，很多地区的医保卡和社保卡是一体的。因为医保卡只用于治疗，功能相对单一，所以场景相对单一。而且新的社保公布后，社保一卡通功能更加完善，还包括医保卡的功能。因此，许多地区逐渐终止使用以前的医疗保险卡，将医疗保险卡和社会保障卡合并成一张卡，被保险人只需使用社会保障卡中的医疗保险账户。当然，在一些地区，医疗保险卡和社会保障卡仍然是分开的。随着社会保障卡的全民化，一段时间后可能会依法取缔医疗保险卡。
三、电子医保个人账户余额为0处理方法
1、单位已正常缴纳职工医保费用，但单位没有发放实体社保卡：本人之前没有办理过社保卡，这种情况需先联系工作单位办理社保卡、医保能正常圈存后个人账户才会有余额；本人之前参加居民医保时发了的社保卡，这种情况需联系社保卡发卡行激活个人医保账户（注意非金融账户）后，方可使用；
2、去银行查询医保个人账户余额非0，而医保系统查询、药店或医院刷卡时均提示余额为0，这种情况有可能是因为参保人有资金担保等情况，由等执法机构将个人资金予以冻结，建议去发卡银行查询医保账户状态和金融账户状态，询问账户异常的原因。
一般来说，医保卡里的钱是不能取出来的，只能在定点医院和药店看病买药。不过，以下几种情况还是可以取的：
1、医保卡使用终止：如参保人死亡，亲属可凭死亡证明等办理支取手续；
2、参保人移民：凭门出具的证明等办理支取手续；
3、异地转移：在当地参保后，可把医保账户余额转移至新账户
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》第二十三条
国有企业、事业单位职工参加基本养老保险前，视同缴费年限期间应当缴纳的基本养老保险费由承担。
基本养老保险基金出现支付不足时，给予补贴。
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