限速40开了46不会扣分的。在限速40km的道路上开46，属于超过规定时速10%以上未达20%的范围。根据相关规定，对于在限速40km的路段超过规定车速50%以下的违法行为，交警只警告，不罚款也不会扣分；超速50%以上，则要被罚款并被记分。
超速罚款的标准是什么
1、超过规定时速10%以下，罚款50元；
2、超过规定时速10%以上不足50%的，罚款200元；
3、超过规定时速50%以上不足70%的，罚款500元；
4、超过规定时速70%以上不足100%的，罚款1000元；
5、超过规定时速100%的，罚款2000元。
法律依据：《中华人民共和国道路交通安全法》第四十二条
机动车上道路行驶，不得超过限速标志标明的最高时速。在没有限速标志的路段，应当保持安全车速。
夜间行驶或者在容易发生危险的路段行驶，以及遇有沙尘、冰雹、雨、雪、雾、结冰等气象条件时，应当降低行驶速度。
《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第四十五条
机动车在道路上行驶不得超过限速标志、标线标明的速度。在没有限速标志、标线的道路上，机动车不得超过下列最高行驶速度：
（一）没有道路中心线的道路，城市道路为每小时30公里，公路为每小时40公里；
（二）同方向只有1条机动车道的道路，城市道路为每小时50公里，公路为每小时70公里。
