劳动者恶意请求支付双倍工资差额的处理是：对其诉求不予支持。因为劳动合同法规定，签署劳动合同应遵循诚实信用的原则，恶意请求支付双倍工资有违这一原则，也不符合需支付双倍工资的构成要件。
【法律依据】
《中华人民共和国劳动合同法》第三条
订立劳动合同，应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百一十二条
当事人之间恶意串通，企图通过诉讼、调解等方式侵害他人合法权益的，人民应当驳回其请求，并根据情节轻重予以罚款、拘留；构成犯罪的，依法追究刑事责任
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