撤案后不会有案底。
撤案，说明并没有对行为人实行刑事审判，也没有作出有罪判决。所以行为人不会有案底。但是不能保证，不会作记录；治安管理作出的警告、拘留和罚款是不会留下记录的，只有刑事处罚才会记录在档案中。行为人是无法消除已经被记录在档案中的违法事实的，案底会在档案里永久保留。案底一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录。又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，而该犯罪档案一般存放至门保存。撤案，即说明并未对行为人进行刑事审判，未作出有罪判决，因此不会有案底。但不排除在机关处，会有相应的事件记录。
撤案的流程：
1、机关撤销案件，应当报上级领导审批，然后写出撤销案件的报告；
2、决定撤销的，应当作出书面决定；
3、撤销案件决定：机关经过案件侦查，认为不应当追究犯罪嫌疑人的刑事责任。撤销案件是依法作出的文件，称为撤销案件决定；
4、派出所的立案只是为了调查，在调查过程中，如果事实不清或证据不足，派出所将停止调查。
综上所述，撤案后一般就是就没事了。但是，机关原来所做的笔录不能申请消除。在一定年限之后，有的地方规定两年，也有规定五年的，当事人没有重新犯罪的，原来的笔录就会被清理销毁；治安管理处罚的警告、拘留、罚款不记录档案，只有刑事处罚才进入档案留下案底，具体可到门查询。
【法律依据】：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十六条
犯罪的时候不满十八周岁，被判处五年有期徒刑以下刑罚的，应当对相关犯罪记录予以封存。
犯罪记录被封存的，不得向任何单位和个人提供，但司法机关为办案需要或者有关单位根据国家规定进行查询的除外。依法进行查询的单位，应当对被封存的犯罪记录的情况予以保密。
