草莓根腐病一般采用药剂灌根的方法防治，药剂可选择30%霉灵水剂1200-1500倍液、甲霜·恶霉灵1500倍液、普利登鱼蛋白500倍液等，对灌根2次，间隔一周左右进行。草莓根腐病主要以防治为主，需合理轮作，及时清理田间的病株以及植物。
草莓根腐病在发病初期，选用霜霉威、甲霜灵、恶霉灵或者乙酸素进行兑水，然后淋根防治；一周后再选用枯草芽孢杆菌、哈茨木霉菌等药剂再喷淋根部进行防治。
发现病株，及时拔除，集中烧毁或深埋，病穴施用生石灰进行消毒。在定植缓苗后，用育苗清150倍液加丰抗素灌根1次。发病初期，采用70%敌克松1000倍液或50%多菌灵1000倍液灌根，隔7～10d灌1次，连用2～3次。
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