法律分析：证券基金经济纠纷中的损失计算方法主要包括“净损失”和“赔偿损失”两种方式。净损失指的是因受到证券交易的影响而导致的投资损失，是指投资者实际持有资产的价值减去未受损失影响时的价值。而赔偿损失则是指因证券基金运作不当导致投资者遭受的损失，其计算方法通常以纠纷发生时证券价格的市场价值为基础。
法律依据：
1.《中华人民共和国证券法》第七十三条，规定了证券交易时的信息披露、虚假陈述等行为的违法责任。
2.《基金法》第十四条，规定了基金管理人的违法责任和投资者的救济途径。
3.《中华人民共和国民事诉讼法》第一百零一条，规定了民事诉讼中的损失计算方法和证明责任。
根据以上法律依据和损失计算原则，投资者应当依据证券价格的市场价值和自身实际持有资产的价值计算自身的经济损失，并通过合法渠道提出诉讼要求赔偿。而基金管理人在违反法律规定或协议约定的情况下，应当承担赔偿责任。
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