单位是不得随意克扣员工工资的，员工和单位协商一致，经单位同意，员工申请辞职当天就安排员工离职，单位不得克扣员工工资。如果未经单位同意员工自行离职，那么单位可以按照员工严重违纪扣除部分奖励性待遇作为处罚，但是不得克扣员工工资。
法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》 第三十七条 劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
《工资支付暂行条例》
第十 各级劳动行政部门有权监察用人单位工资支付的情况。用人单位有下列侵害劳动者合法权益行为的，由劳动行政部门责令其支付劳动者工资和经济补偿，并可责令其支付赔偿金：
（一）克扣或者无故拖欠劳动者工资的；
（二）拒不支付劳动者延长工作时间工资的；
（三）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的。 经济补偿和赔偿金的标准，按国家有关规定执行。
第十九条 劳动者与用人单位因工资支付发生劳动争议的，当事人可依法向劳动争议仲裁机关申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民提起诉讼。
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