如果遇到工伤,公司不配合盖章的，劳动者是可以自行向劳动部门申请工伤认定的。

具体办理流程是：
一、申请环节。工伤保险部门根据申请人提交的材料出具《收件回执》，如材料不齐的出具《补齐材料告知书》;
二、受理环节。基本资料收齐核实且符合受理条件后，工伤保险经办部门对符合受理条件的予以受理，出具《受理通知书》，对不符合条件的出具《不予受理决定书》;
三、承办环节。如申请人为受伤害的职工或其近亲属、工会组织，工伤保险部门应向用人单位发出《关于伤亡事故调查处理的通知》，核实有关情况。收到用人单位书面回复后，如双方有争议，工伤部门进行调查、核实;
四、办结环节。工伤保险部门就做出工伤认定的书面决定，并送达申请工伤认定的职工或者其近亲属、工会组织以及该职工所在单位。

一、申请工伤调整期间公司不配合怎么办？
申请工伤公司不配合，劳动者可以自己到用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门申请工伤认定。
《工伤保险条例》第十七条第一、二款规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
二、公司不配合工伤认定怎么办
依据我国工伤保险条例规定，工伤认定公司不配合时，工伤职工或者其直系亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。
根据《工伤保险条例》第十七条第二款规定，用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其直系亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区劳动保障行政部门提出工伤认定申请。
三、申请工伤公司不配合怎么办？
申请工伤公司不配合，劳动者可以自己到用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门申请工伤认定。
《工伤保险条例》第十七条第一、二款规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。
用人单位未按前款规定提出工伤认定申请的，工伤职工或者其近亲属、工会组织在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内，可以直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。

　需要注意的是，在申请过程中，要确保准备齐全必要的证明材料，如医院诊断证明、工资单、劳动合同等相关证明文件，以便更好地证明工伤事件的发生。在涉及工伤认定的事务中，应特别注重证明材料的真实性和可靠性，避免提供虚明，否则将会承担相应的法律责任。

【法律依据】：
《工伤保险条例》
第十四条职工有下列情形之一的，应当认定为工伤：
（一）在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的；
（二）工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害的；
（三）在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害的；
（四）患职业病的；
（五）因工外出期间，由于工作原因受到伤害或者发生事故下落不明的；
（六）在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的；
（七）法律、行规规定应当认定为工伤的其他情形。
第三十条职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。
职工治疗工伤应当在签订服务协议的医疗机构就医，情况紧急时可以先到就近的医疗机构急救。
治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准，由社会保险行政部门会同卫生行政部门、食品药品监督管理部门等部门规定。
职工住院治疗工伤的伙食补助费，以及经医疗机构出具证明，报经办机构同意，工伤职工到统筹地区以外就医所需的交通、食宿费用从工伤保险基金支付，基金支付的具体标准由统筹地区规定。
工伤职工治疗非工伤引发的疾病，不享受工伤医疗待遇，按照基本医疗保险办法处理。
工伤职工到签订服务协议的医疗机构进行工伤康复的费用，符合规定的，从工伤保险基金支付。