医疗机构负责人要承担哪些责任，要依据实际情况而定。如果发生重大医疗事故的，一般是给给予行政处分或者纪律处分。
《医疗事故处理条例》
第五十五条医疗机构发生医疗事故的，由卫生行政部门根据医疗事故等级和情节，给予警告；情节严重的，责令限期停业整顿直至由原发证部门吊销执业许可证，对负有责任的医务人员依照刑法关于医疗事故罪的规定，依法追究刑事责任；尚不够刑事处罚的，依法给予行政处分或者纪律处分。
对发生医疗事故的有关医务人员，除依照前款处罚外，卫生行政部门并可以责令暂停6个月以上1年以下执业活动；情节严重的，吊销其执业证书。
第五十六条医疗机构违反本条例的规定，有下列情形之一的，由卫生行政部门责令改正；情节严重的，对负有责任的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分或者纪律处分：
(一)未如实告知患者病情、医疗措施和医疗风险的；
(二)没有正当理由，拒绝为患者提供复印或者复制病历资料服务的；
(三)未按照卫生行政部门规定的要求书写和妥善保管病历资料的；
(四)未在规定时间内补记抢救工作病历内容的；
(五)未按照本条例的规定封存、保管和启封病历资料和实物的；
(六)未设置医疗服务质量监控部门或者配备专(兼)职人员的；
(七)未制定有关医疗事故防范和处理预案的；
(八)未在规定时间内向卫生行政部门报告重大医疗过失行为的；
(九)未按照本条例的规定向卫生行政部门报告医疗事故的；
(十)未按照规定进行尸检和保存、处理尸体的。
一、做医疗事故鉴定要找哪个部门
一般地，如果需要做医疗事故鉴定，可以到当地卫生行政部门申请鉴定。
并且，医疗事故鉴定通常需要走以下流程：
申请或者委托--受理--初次鉴定--补充鉴定--出具鉴定。
当然了，如果对鉴定不服的，可以重新申请鉴定。并且，任何一方当事人对首次医疗事故技术鉴定结论不服的，可以从收到首次医疗事故技术鉴定书之日起15日内，向原受理医疗事故争议处理申请的卫生行政部门提出再次鉴定的申请，或由双方当事人共同委托省、自治区、直辖市医学会组织再次鉴定。
另外，做医疗鉴定需要一定的费用，通常按以下方式解决：
1、经鉴定属于医疗事故的，鉴定费用由医疗机构支付；
2、经鉴定不属于医疗事故的，鉴定费用由医疗事故处理申请的一方当事人支付。
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