被羁押期间的工资，按如下规定执行：
国家机关和事业单位工作人员被羁押期间停发工资。、检察机关撤案或者检察机关决定不予以起诉以及检察机关虽决定起诉而宣判无罪的，按下列原则分别处理：
犯罪嫌疑人未被劳动教养或治安拘留，原单位也未给予行政纪律处分的，由原单位补发其被羁押期间的工资、奖金、津贴、补贴；如未被劳动教养或治安拘留，原单位给予行政纪律处分的，其被羁押期间的工资问题按照被取保候审和监视居住的工资处理办法执行；
如被劳动教养、治安拘留的，其被羁押期间减发和扣发的工资、奖金、津贴、补贴不予补发。决定免予追究刑事责任的，被羁押期间减发和扣发的工资、奖金、津贴、补贴也不予补发。
一、羁押期限重新计算的情形
根据刑事诉讼法和六机关《规定》的规定，具体有以上情况需要重新计算羁押期限，其中在侦查期间，发现犯罪嫌疑人另有重要罪行的，自发现之日起依照《刑事诉讼法》第154条的规定重新计算侦查羁押期限。
1、在侦查期间，发现犯罪嫌疑人另有重要罪行的，自发现之日起依照《刑事诉讼法》第154条的规定重新计算侦查羁押期限。重新计算侦查羁押期限的，由机关决定，无需人民批准，但须报人民备案。
2、机关补充侦查完毕移送后，人民重新计算审查期限。
3、人民补充侦查的案件，补充侦查完毕移送人民后，人民重新计算审理期限。
4、人民改变管辖的案件，从改变后的人民收到案件之日起重新计算审理期限
5、第二审人民发回重审人民重新审判的案件，原审人民自收到发回案件之日起，重新计算审理期限。
6、简易程序转为普通程序的案件，审理期限应当从决定转为普通程序之日起计算。
二、其他规定
1、犯罪嫌疑人不讲真实姓名、住址，身份不明的，侦查羁押期限自查清其身份之日起计算，但不得停止对其犯罪行为的侦查取证。对于犯罪事实清楚，证据确实、充分的，也可以按其自报的姓名移送人民审查起诉。
2、对被羁押的犯罪嫌疑人作精神病鉴定的时间，不计入侦查羁押期限。其他鉴定时间则应当计入羁押期限。
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