法律分析：
1、的印制要求不同：根据规定：专用由税务主管部门指定的企业印制；其他，按照主管部门的规定，分别由省、自治区、直辖市国家税务局、地方税务局指定企业印制。未经前款规定的税务机关指定，不得印制。
2、使用的主体不同：专用一般只能由一般纳税人领购使用，小规模纳税人需要使用的，只能经税务机关批准后由当地的税务机关代开；普通则可以由从事经营活动并办理了税务登记的各种纳税人领购使用，未办理税务登记的纳税人也可以向税务机关申请领购使用普通。
3、使用的主体不同：专用一般只能由一般纳税人领购使用，小规模纳税人需要使用的，只能经税务机关批准后由当地的税务机关代开；普通则可以由从事经营活动并办理了税务登记的各种纳税人领购使用，未办理税务登记的纳税人也可以向税务机关申请领购使用普通。
4、的联次不同：专用有四个联次和七个联次两种，第一联为存根联（用于留存备查），第二联为联（用于购买方记账），第三联为抵扣联（用作购买方扣税凭证），第四联为记账联（用于销售方记账），七联次的其他三联为备用联，分别作为企业出门证、检查和仓库留存用；普通则只有三联，第一联为存根联，第二联为联，第三联为记账联。
5、的作用不同：专用不仅是购销双方收付款的凭证，而且可以用作购买方扣除的凭证；而普通除运费、收购农副产品、废旧物资的按法定税率作抵扣外，其他的一律不予作抵扣用。
法律依据：
《中华人民共和国税收征管法》 第二十二条 专用由税务主管部门指定的企业印制；其他，按照主管部门的规定，分别由省、自治区、直辖市国家税务局、地方税务局指定企业印制。未经前款规定的税务机关指定，不得印制。
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