法律分析：如果公司违反公司治理结构，可能会导致公司内部管理混乱，股东权益受损，员工权益受损等问题。公司应当依法进行合规经营，加强公司治理结构建设，否则将可能面临各种法律后果，包括法律责任和经济损失等。
法律依据：
1.《公司法》第七十五条：“公司应当建立健全公司治理结构，加强公司内部管理和监督，维护股东权益和其他利益相关者合法权益。”
2.《证券法》第九十：“发行人、上市公司及其董事、监事、高级管理人员、股东应当遵守法律、法规、规章，依法行使权利、履行义务，保证信息披露真实、准确、完整、及时，维护投资者特别是中小投资者的合法权益，不得欺诈、误导投资者，扰乱证券市场正常秩序。”
3.《公司法》第一百零五条：“公司违反法律、法规或者公司章程的规定或者股东会、董事会的决议，损害公司、股东或者债权人利益的，责任人应当承担赔偿责任。”
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