目前针对慢性特殊病规定的报销比例，最高可达90%。但由于医疗机构的级别不同，报销比例也存在差别。不同地区的医疗门诊，可接纳的特殊病种类，在不断扩充，像地中海贫血、血吸虫病、结核病、癫痫、儿童生长激素缺乏症等，这些常见类型的疾病多达三十余种，如果在一级医疗机构进行住院治疗，报销比例为90%，二级医疗机构的报销比例为80%，三级医疗机构的报销比例在60%左右。此外，患者的具体情况不同，报销比例存在差异。每个城市及地区，呈现出来的实际情况，具有一定差别，像来自农村地区的贫困患者，其报销补偿比例可达90%，但前提是必须建档立卡，能证明自己的贫困身份，达到条件之后才能享受此类报销。
法律依据
《社会保险法》第二十六条职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
第二十符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。"
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