瑕疵股权转让合同有效。但如果股权转让人隐瞒股权存在瑕疵的事实，股权受让人在订立合同时，对此不知或不应知道是，该瑕疵股权转让合同效力待定，当受让人申请撤销时，该合同无效，当受让人接收时，该合同有效。
【法律依据】
《中华人民共和国民法典》第一百四十
一方以欺诈手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受欺诈方有权请求人民或者仲裁机构予以撤销。
第一百四十九条
第三人实施欺诈行为，使一方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，对方知道或者应当知道该欺诈行为的，受欺诈方有权请求人民或者仲裁机构予以撤销。
第六百一十当事人约定减轻或者免除出卖人对标的物瑕疵承担的责任，因出卖人故意或者重大过失不告知买受人标的物瑕疵的，出卖人无权主张减轻或者免除责任。
