商铺40年的土地使用产权到期后，当事人可以根据当时的地价水平补缴土地出让金，再次申请土地使用权。商业用地全国统一执行的土地使用年限为40年，届满时权利人可以提前一年提出续期申请。
一、到土地使用权到期该怎么办
土地的使用权年限到2035年届满到期的，可以根据当时的地价水平补缴土地出让金，再次申请土地使用权。住宅建设用地使用权期间届满的，自动续期。土地使用到期可以提前一年提出续期申请补交土地出让金，再次申请的期限应当不超过30年。
二、新规土地使用权到期的如何处理
新规土地使用权到期可以根据当时的地价水平补缴土地出让金，再次申请土地使用权。住宅建设用地使用权期间届满的，自动续期。土地使用到期可以提前一年提出续期申请补交土地出让金，再次申请的期限应当不超过30年。
【本文关联的相关法律依据】
《城镇国有土地使用权出让和转让暂行条例》第十二条
土地使用权出让最高年限按下列用途确定：
（一）居住用地七十年；
（二）工业用地五十年；
（三）教育、科技、文化、卫生、体育用地五十年；
（四）商业、旅游、娱乐用地四十年；
（五）综合或者其他用地五十年。
《城市房地产管理法》第二十一条
土地使用权出让合同约定的年限届满，土地使用者需要继续使用的，应当至迟于届满前一年申请续期，除根据社会公共利益需要收回该幅土地的，应当予以批准。续期的，应重新签订土地使用权出让合同，依照规定支付土地使用权出让金。
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