医院技术合同工和正式职工的区别是：待遇不同、权限不同、招聘不同等，对于技术合同工与正式职工的不同情况就是上述这些，双方在签订合同时，应当对有关事项进行合法的认定处理。
1、待遇不同：合同工的工资是用人部门内部经费发放，工资普遍较低，扣除社保之后，会更低;正式工的工资是由国家财政保障，相对稳定，而且工资较高，退休后的待遇也不错。
2、工作权限不同：合同工在日常管理活动中，只能是协助管理，而正式工具有管理权，可以指挥合同工协助管理。
3、招聘方式不同：合同工是通过人事部门，或者人事部门自行发布招聘信息，通过面试流程后，与用人部门签订劳动合同，建立的是劳动关系;正式工则是通过公、事业单位考试和军官转业安置等方式获取编制而上岗工作。
一、在编和编外的区别
事业编是国家统一拨款，且待遇是合同人员的3倍左右，合同工通常是用人单位内部经费解决，通常待遇要低很多，这就是相当于以前所说的临时工。
合同工：是指企业、事业单位通过签订合同招收的短期性工人。合同一般采取书面形式，内容包括时限、任务及共同遵守的各项义务等。1986年中国用工制度改革以后招收的各类工人一般都是合同工。1986年7月12日，发布《国营企业实行劳动合同制暂行规定》和《国营企业招用工人暂行规定》，指出企业在国家劳动工资计划指标内招用常年性工作岗位上的工人，除国家另有特别规定者外，统一实行劳动合同制。企业招用合同工采取公开招收、自愿报名、德智体全面考核、择优录用的原则。合同工与所在单位固定工享有同等的劳动、工作、学习、参加企业民主管理、获得政治荣誉和物质鼓励等权利。国家对劳动合同制工人退休养老实行社会保险制度。退休养老基金由企业和劳动合同制工人缴纳，退休养老金不敷使用时，国家给予适当补助。实行合同工制的根本目的在于，打破铁饭碗、大锅饭，真正实行各尽所能、按劳分配，充分调动劳动者的生产积极性，提高企业劳动者的素质。
所谓编制人员就是具有国家（人事部门）正式编制的工作人员，其基本工资和地方性补助都是财政拨款的，现在要进入编制都要经过公开招考的。非编制人员就是事业单位自行聘用的（包括临时工），就像企业聘用一样，不由财政拨款。
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