发现公司印章被盗，应当及时作如下处理，否则公司将面临印章盗用以后对他人造成损失担责的风险：
①保护现场、及时报警，尽快报送立案;
②报警以后，如拒绝刑事立案，一定要求出具不予立案通知书，并且自行详细记录被盗过程;
③报警的同时，应及时通知相关交易方并登报公示，说明印章被盗情况并声明作废;
④重新刻制公章并提交备案。
【本文关联的相关法律依据】
《最高人民关于在审理经济纠纷案件中涉及经济犯罪嫌疑若干问题的规定》第五条第二款
行为人私刻单位公章或者擅自使用单位公章、业务介绍信、盖有公章的空白合同书以签订经济合同的方法进行犯罪行为，单位有明显过错，且该过错行为与被害人的经济损失之间具有因果关系的，单位对该犯罪行为所造成的经济损失，依法应当承担赔偿责任。
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