法律分析:

一、按照《企业所得税税法》规定，企业所得税在机构注册地缴纳，分公司都是非法人机构，这样的话所有税收都会缴纳到总机构所在地。这就会对分公司所在地的税收收入有影响，必然会造成各地争夺总机构。总局出台企业所得税汇总分摊的缴纳办法，主要目的是均衡各地税源，是从税收收入的公平性出发的，同时也避免对企业经营造成影响。所以对于企业来讲，不存在利弊，要说分摊缴纳缺点就是记账麻烦了，分支机构也需要完成申报。另外根据汇总缴纳企业所得税办法，设立跨地区分公司，30日内是必须到税务局办理相对应备案的。分支机构是否就地预缴，最后也是要当地税务机关审批的。

二、公司缴纳税务的方式：纳税人应当按照主管国家税务机关确定的征收方式缴纳税款。

(一)自核自缴。生产经营规模较大，财务制度健全，会计核算准确，一贯依法纳税的企业，经主管国家税务机关批准，企业依照税法规定，自行计算应纳税款，自行填写、审核纳税申报表，自行填写税收缴款书，到开户银行解缴应纳税款，并按规定向主管国家税务机关办理纳税申报并报送纳税资料和财务会计报表。

(二)申报核实缴纳。生产经营正常，财务制度基本健全，帐册、凭证完整，会计核算较准确的企业依照税法规定计算应纳税款，自行填写纳税申报表，按照规定向主管国家税务机关办理纳税申报，并报送纳税资料和财务会计报表。经主管国家税务机关审核，并填开税收缴款书，纳税人按规定期限到开户银行缴纳税款。

(三)申报查定缴纳。即财务制度不够健全，帐簿凭证不完备的固定业户，应当如实向主管国家税务机关办理纳税申报并提供其生产能力、原材料、能源消耗情况及生产经营情况等，经主管国家税务机关审查测定或实地查验后，填开税收缴款书或者完税证，纳税人按规定期限到开户银行或者税务机关缴纳税款。

(四)定额申报缴纳。生产经营规模较小，确无建帐能力或者帐证不健全，不能提供准确纳税资料的固定业户，按照国家税务机关核定的营业(销售)额和征收率，按规定期限向主管国家税务机关申报缴纳税款。纳税人实际营业(销售)额与核定额相比升降幅度在20%以内的，仍按核定营业(销售)额计算申报缴纳税款;对当期实际营业(销售)额上升幅度超过20%的，按当期实际营业(销售)额计算申报缴纳税款;当期实际营业(销售)额下降幅度超过20%的，当期仍按核定营业(销售)额计算申报缴纳税款，经主管国家税务机关调查核实后，其多缴税款可在下期应纳税款中予以抵扣。需要调整定额的，向主管国家税务机关申请调升或调降定额。但是对定额的调整规定不适用实行起点定额或保本定额缴纳税款的个体工商户。

法律依据:

《中华人民共和国企业所得税法》

第三十 对非居民企业在中国境内取得工程作业和劳务所得应缴纳的所得税，税务机关可以指定工程价款或者劳务费的支付人为扣缴义务人。

第三十九条 依照本法第三十七条、第三十规定应当扣缴的所得税，扣缴义务人未依法扣缴或者无法履行扣缴义务的，由纳税人在所得发生地缴纳。纳税人未依法缴纳的，税务机关可以从该纳税人在中国境内其他收入项目的支付人应付的款项中，追缴该纳税人的应纳税款。

第四十条 扣缴义务人每次代扣的税款，应当自代扣之日起七日内缴入国库，并向所在地的税务机关报送扣缴企业所得税报告表。