一、行政机关损毁扣押财物如何处理
1、行政机关对财物进行查封、扣押、冻结后，如果损毁该财物的，对当事人造成损失，应当依法予以赔偿。
2、行政机关承担赔偿责任后，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，可以进行追偿，并且给予相应处分。
3、法律依据：《中华人民共和国行政处罚法》第八十条
二、行政处罚执法权的限定是怎样的
（1）职务身份保障权。职务身份保障权是指行政执法人员经有关国家机关选举或任命担任某一职务后所享有的受法律保护的权利。行政执法人员一经合法选任后，非经选任机关同意并履行法定程序，其他任何组织和个人都无权罢免、撤消其职务。
（2）履行职务权。行政执法人员经合法任命，获得一定的职务后，就享有该职务所附带的权利。行政执法人员依法履行职务，行使相应的职权，是受法律保护的，任何人不能任意剥夺。履行职务权主要包括：①调查权。即为履行职务而询问相对人或其他人员以及查询、调阅有关材料和资料的权力。②取证权。即要求有关人员提供证言、证据并予以查实的权力。③决定权或执行决定权。即可以根据已有的证据作出某种决定或根据本机关的决定将其付诸实施的权力。
（3）经济保障权。即行政执法人员所享有的依法保障其工资、退休金、抚恤金等经济利益的权利。工资、退休金等都是国家依法提供给行政执法人员的经济利益，任何组织或个人都不得随意增减或取消。如果因行政执法人员违法或犯罪而必须予以减少或撤消其享有的经济利益时，也必须履行相应的程序。
（4）申诉权。行政执法人员如遭不公正处理或诬陷、打击报复时，有权依法定程序向有关国家机关申诉。
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