区别如下：
1、性质不同
前者含有人民行使审判权的性质，后者则是当事人在诉讼中对自己诉讼权利和实体权利的处分。
2、参加的主体不同
前者有人民和双方当事人共同参加，后者只有双方当事人自己参加。
3、效力不同
根据法庭调解达成协议制作的调解书生效后，诉讼归于终结，有给付内容的调解书具有执行力；当事人在诉讼中和解的，则应由原告申请撤诉，经裁定准许后结束诉讼，和解协议不具有执行力。
法律依据:
《中华人民共和国民事诉讼法》 第一百四十五条 宣判前，原告申请撤诉的，是否准许，由人民裁定。
人民裁定不准许撤诉的，原告经传票传唤，无正当理由拒不到庭的，可以缺席判决。
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