c2不能扣c1的分，C1机动车驾驶证可以驾驶手动挡版本车辆，C2机动车驾驶证只能够驾驶自动挡版本车辆，是无法进行扣除分数的，机动车驾驶证只能够给自己的准驾车型来进行扣分，否则将是属于不按照准驾车型驾驶车辆。
C2机动车驾驶证能够驾驶的准驾车型如下：
可以驾驶的车型是小型自动挡载客汽车，微型自动挡载客汽车，轻型自动挡载货汽车，微型自动挡载货汽车，其余不允许驾驶证和车辆，机动车驾驶证的申请年龄是18周岁以上，最高年龄不做上线，只要符合体检，就可以。
综上所述，每个人也只有一个驾照，如果通过追加驾驶证的方式取得c1准驾车型，那么c1和c2驾驶证合二为一，共享12分，也就没有代扣分一说。
【法律依据】：
《机动车驾驶证申领和使用规定》第十四条
c1是小型汽车的准驾车型代号，准予驾驶的其他准驾车型是c2、c3、c4。c2是小型自动挡汽车的准驾车型代号，准予驾驶的其他准驾车型是c3、c4。因此从上述规定来看，如果c1小型汽车违章，不能用c2驾照扣分的。而如果是c2自动挡汽车违章，肯定可以用c1驾照消除记分。
