灵活就业人员缴纳医疗保险有档次。

灵活就业人员医保缴费标准是根据其所在地区的平均工资水平确定的。具体来说，灵活就业人员医保缴费标准分为两个档次：低档：按照所在地区职工月平均工资的60%计算，最低不低于当地最低工资标准。高档：按照所在地区职工月平均工资的300%计算，最高不超过当地最高工资标准的300%。

根据我国现行的医疗保险制度，灵活就业人员可以选择参加城镇居民基本医疗保险或者新型农村合作医疗。这两种医疗保险制度都设有不同的缴费档次，灵活就业人员可以根据自己的实际情况和经济能力选择合适的缴费档次。

城镇居民基本医疗保险是针对城镇非在职职工和无业居民设立的一种医疗保险制度。参保人员可以根据自己的经济能力选择不同的缴费档次，一般分为高档、中档和低档三个档次。高档缴费对应的保险待遇较高，但个人需要缴纳的保险费也相对较高；中档缴费对应的保险待遇适中，个人需要缴纳的保险费也适中；低档缴费对应的保险待遇较低，个人需要缴纳的保险费也相对较低。

新型农村合作医疗是针对农村居民设立的一种医疗保险制度。参保人员同样可以根据自己的经济能力选择不同的缴费档次，一般分为高档、中档和低档三个档次。与城镇居民基本医疗保险类似，高档缴费对应的保险待遇较高，但个人需要缴纳的保险费也相对较高；中档缴费对应的保险待遇适中，个人需要缴纳的保险费也适中；低档缴费对应的保险待遇较低，个人需要缴纳的保险费也相对较低。

在选择缴费档次时，灵活就业人员需要综合考虑自己的经济状况、健康状况和对医疗保险的需求。一般来说，如果经济条件较好，可以选择高档缴费，以便在生病或受伤时获得更高的保险待遇；如果经济条件一般，可以选择中档缴费，既能保障基本的医疗需求，又能避免过高的保险费负担；如果经济条件较差，可以选择低档缴费，虽然保险待遇较低，但至少能够获得一定程度的医疗保障。

此外，灵活就业人员在选择缴费档次时还需要注意以下几点：

1、不同地区的医疗保险制度可能有所不同，具体缴费档次和保险待遇请以当地为准。

2、选择缴费档次后，一般情况下不能随意更改。如需更改，需按照相关规定办理手续。

3、选择高档缴费并不意味着一定能获得高档的保险待遇。实际保险待遇还需根据个人的医疗费用、医保支付范围等因素综合计算。

综上所述：灵活就业人员缴纳医疗保险是有档次的。可以根据自己的实际情况和经济能力选择合适的缴费档次，以便在生病或受伤时获得相应的医疗保障。在选择缴费档次时，务必要充分了解当地的医疗保险，合理规划自己的医疗保险需求和经济状况。

【法律依据】：

《中华人民共和国社会保险法》

第十三条

国有企业、事业单位职工参加基本养老保险前，视同缴费年限期间应当缴纳的基本养老保险费由承担。基本养老保险基金出现支付不足时，给予补贴。

第六十条

用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加社会保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员，可以直接向社会保险费征收机构缴纳社会保险费。