发工资少发了200的处理方法如下：
1、首先与用人单位的人力资源部门或财务部门联系，确认工资数额的正确性，并要求补发少发的部分；
2、如果用人单位拒绝补发，可以向当地劳动监察部门投诉，要求其介入调查并督促用人单位按规定补发工资；
3、同时，应保存好相关证据，如工资条、银行转账记录等，以便在必要时提供给劳动监察部门或用于劳动仲裁；
4、如果问题依然无法解决，可以申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。如果对仲裁结果不满意，还可以向提起诉讼。
工资核算的常见问题：
1. 核算错误：由于人工输入错误或系统故障导致工资计算不准确；
2. 缺少加班费：未将员工的加班时间计入工资中；
3. 扣除项目不明确：扣除的各项费用没有明细说明，导致员工不清楚工资减少的原因；
4. 社保公积金计算错误：社保和公积金的缴纳基数或比例错误，影响到工资的最终发放；
5. 税务处理不当：个人所得税扣除不准确，可能会导致工资发放多或少；
6. 奖金或补贴遗漏：应发的奖金、补贴等额外收入未计入工资总额中。
综上所述，当发现工资少发200时，可以先与用人单位联系要求补发，若被拒绝可向劳动监察部门投诉并保存相关证据，最后可申请劳动仲裁或向提起诉讼，以维护自己的合法权益。
【法律依据】：
《劳动争议调解仲裁法》
第九条
用人单位违反国家规定，拖欠或者未足额支付劳动报酬，或者拖欠工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金的，劳动者可以向劳动行政部门投诉，劳动行政部门应当依法处理。
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