住院费和手术费不是分开交的。
手术费和住院费缴纳方式：
住院费的一切费用都从你的住院费里扣，手术费也是从住院费里扣除的，因为在住院之前是交了一些押金的，所以手术的时候，不会再另外收一笔钱，那样会非常麻烦，直接从社保卡里扣除就可以。走医院账户上的钱。
医保报销范围中的住院补偿包括：
药费：辅助检查：心脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费限额200元；手术费参照国家标准，超过1000元的按1000元报销。
综上所述，医院的手术费也是在住院处扣的，不用直接去手术室交的。手术费就在住院压金里面扣，不够了就再去住院处交费，医院就是这么一个收费方式，只要是住院了，什么费用都要从住院费用里面去扣除，出院时一起结算。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》第二十
符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
第二十九条
参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。
社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
