不一样。县外医疗，新农合转诊窗口在为患者办理纸质转诊手续的过程中，同时进行网上电子转诊，这种情况报销比例是一样的，另外急诊、重症精神病，不需办理纸质转诊，可通过电话直接实施电子转诊，其报销比例出不会降低。非急诊和重症精神病，不先办理纸质转诊手续，直接去外地住院，住院后通过电话实施网上电子转诊，这种情况称非正常转诊，报销比例下调20%，这样报销比例就不一样了。正常情况下，要先到本县县级医疗机构就诊，因病情严重，该院医疗条件，医生会建议县外医疗，并出具转诊转院证明，再到县农合转诊窗口审批，然后到指定的医院就诊治疗，这种情况称之为逐级转诊，也叫正常转诊，报销比例不会降低。
住院开转诊证明就能按照正常比例报销，很多地方的三甲医院报销比例55%，如果有转诊证明就按照55%报销，没有的话就按照35%报销。也就是降低百分之二十。”电子转诊单与书面转诊证明报销比例不一样。县外医疗，新农合转诊窗口在为患者办理纸质转诊手续的过程中，同时进行网上电子转诊，这种情况报销比例是一样的，另外急诊、重症精神病，不需办理纸质转诊，可通过电话直接实施电子转诊，其报销比例出不会降低。非急诊和重症精神病，不先办理纸质转诊手续，直接去外地住院，住院后通过电话实施网上电子转诊，这种情况称非正常转诊，报销比例下调20%，这样报销比例就不一样了。
医保这样做才能报销得多:
1、用户去定点医院时，需要去医保有合作的医院，并且是门诊费用都可以报销的定点医院是最好的；
2、用户可以去等级较高的医院，多数城市都是医院等级越低报销比例越低，一级医院报销比例比三级医院好；
3、很多城市医保都是参保越久，每年能报销得越多，因此投保者最好不要出现断交的情形；
4、尽量用医保目录内药物，甲类药品可以全部报销，乙类药可以按比例报销，丙类药则是全部自费；
5、不要私自转院，假如有些疾病，要去外省定点医疗机构住院或门诊法定病种医疗的，需要先申请转院手续，不然转外就医的自理比例再提高10%；
6、异地就诊前进行备案，备案之后可以直接报销，而且报销的比例高一些，倘若不备案需要手动报销，不仅比例低，而且可能无法报销。
法律依据
《社会保险法》
第二十六条
职工基本医疗保险、新型农村合作医疗和城镇居民基本医疗保险的待遇标准按照国家规定执行。
第二十九条
参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位签订服务协议，规范医疗服务行为。
医疗机构应当为参保人员提供合理、必要的医疗服务。
