1、分居三年，可以协议离婚或诉讼离婚，协议离婚是双方协商一致，签订离婚协议书后向婚姻登记机关申请离婚登记，经过离婚冷静期后再申请发给离婚证；诉讼离婚是一方向提起离婚诉讼，审理后，能确定夫妻感情已经破裂，调解无效的情形，应当判决准予离婚。
2、法律依据：
《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条第一款夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
《中华人民共和国民法典》第一千零七十七条自婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请。前款规定期限届满后三十日内，双方应当亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证；未申请的，视为撤回离婚登记申请。
《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条第一款、第二款夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
一、分居三年是否可以自动离婚
1、婚姻关系只能通过离婚登记或者判决或调解的方式解除。分居，不管时间多长，都不能自动解除婚姻关系。但是，夫妻因感情不和分居满二年，则构成夫妻感情确已破裂，在诉讼中，如果调解不成，应当判决准予离婚。但是非因感情不和而分居的，不能适用该项规定。
2、有关规定男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民提出离婚诉讼。人民审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应准予离婚：
(一)重婚或有配偶者与他人同居的；
(二)实施家庭暴力或虐待、遗弃家庭成员的；
(三)有、吸毒等恶习屡教不改的；
(四)因感情不和分居满二年的；
(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提出离婚诉讼的，应准予离婚。解除婚姻关系只有两种途径：到婚姻登记管理机关协议办理，或到人民判决/调解办理，目前，我不承认分居n年就可以自动解除婚姻关系。任何人都不愿意将争议诉诸，除非万不得已。因此，协议离婚，无疑是解除婚姻关系的最佳选择。特别是新的婚姻登记条例颁布后，离婚不再需要当事人单位开具介绍信，个人隐私受到了保护，协议离婚更加方便快捷。但对于双方户口远在外省(市)、而在上海工作生活的当事人来说，通过调解离婚，应该更为方便。如果方法得当，所需费用仅为五十元，可能比回户口所在地的单程车票还便宜，所需时间如果安排得当也不用一个月。另外，对于一方在国外，无法办理国内协议离婚手续，或婚姻缔结地在国外，而欲在国内离婚的当事人，解决无疑是唯一的途径。
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