补充合同的法律效力主要有：
1、依法成立的补充合同，对当事人具有法律约束力；
2、当事人需要按照补充合同的约定全面履行其义务；
3、当事人违约的，需要承担违约责任。
一、合同签订人与开票人不一致怎么办
合同签订人与开票人不一致一般并不影响合同效力，开票如果是合同约定的应当由合同当事人亲自履行的义务的，此时必须经过合同当事人同意，才能够由第三人来履行。如果不是合同规定的义务，可以由他人进行。
根据2021年实施的《民法典》第四百六十五条
依法成立的合同，受法律保护。依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。
第五百二十三条
当事人约定由第三人向债权人履行债务，第三人不履行债务或者履行债务不符合约定的，债务人应当向债权人承担违约责任。
二、协议签字了反悔有效吗
协议签字了，反悔的话，是没有效的，但可以和对方解除合同，或者直接违约，然后承担违约责任的。协议签字之后，如果双方没有在协议中特别约定生效时间的，协议就立即发生法律效力了，对双方当事人都具有约束力，双方当事人都应当履行自己的义务，如果当事人后悔了，那么可以解除合同，或者违约的。
三、办理工程款纠纷应提供哪些证据
拖欠工程款纠纷需要以下证据：
1、证明当事人诉讼主体资格的证据，如营业执照或工商查询资料等；
2、证明建设工程合同关系的成立的证据，如建设工程施工合同、施工过程中增减工程量的补充合同等；
3、证明建设工程合同履行情况的证据；
4、提交诉讼请求的计算依据等。
【本文关联的相关法律依据】
《民法典》第四百六十五条
依法成立的合同，受法律保护。
依法成立的合同，仅对当事人具有法律约束力，但是法律另有规定的除外。
第五百一十条
合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。
第五百七十七条
当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
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