两者适用的情形、两者确立的法条依据、两者制度设计的目的、两者适用的宽严程度、结案后是否继续查控财产不同。
1、两者适用的情形不同。根据《执行立结案规定》17条，适用终结执行有13种情形。根据民诉解释519条，终本适用只有一种情形：被执行人确实无财产可供执行。
2、两者确立的法条依据不同。终结执行为民诉法257条所确立，终-本为民诉解释519条所创设。在使用时，”终本“二字有固定的涵义，特指是终结本次执行程序的简称，而”终结执行“四字也有特定的涵义，两者使用时不要相混淆。
3、两者制度设计的目的不同。终结执行是因为正在进行的执行程序出现了不可能或没有必要继续进行的法定事由，法律规定可依职权裁定结案，而终本是为了探索执行实践中大量确实无财产可供执行案件的推出机制而创设出来的一种制度。
4、两者适用的宽严程度不同。只要出现《执行立结案规定》17条规定的17种情形时，执行可依职权直接作出终结执行的裁定。但终本适用时，为防止执行人员随意认定“无财产可供执行”案件，《执行立结案规定》第16条对“人民穷尽财产调查措施”规定了极其严格的认定条件，以避免损害申请执行人的正当权益。
5、结案后是否继续查控财产不同。以终结执行的方式结案的，虽然申请人的权益没有实现或没有完全实现，但由于执行程序没有必要或不可能继续推进，恢复执行的可能性微乎其微，所以执行不会对终结执行案件的被执行人继续采取财产查控措施。以终-本方式结案的，执行将对其单独管理，仍然在一段时间内继续查控被执行人的财产，并实现对恢复执行案件的动态管理。

终结执行不可恢复的情形。执行终结是指在民事执行程序中，因发生法定的事由，民事执行机关对已经没有必要或者没有可能继续实施执行而结束民事执行程序的制度。从一般意义理解，终结执行即意味着执行程序彻底、不可逆的结束，不存在恢复的可能性。

法律依据：
《关于执行立案件立案、结案若干问题的意见》
第十七条　
有下列情形之一的，可以以“终结执行”方式结案：
（一）申请人撤销申请或者是当事人双方达成执行和解协议，申请执行人撤回执行申请的；
（二）据以执行的法律文书被撤销的；
（三）作为被执行人的公民死亡，无遗产可供执行，又无义务承担人的；
（四）追索赡养费、扶养费、抚育费案件的权利人死亡的；
（五）作为被执行人的公民因生活困难无力偿还借款，无收入来源，又丧失劳动能力的；
（六）作为被执行人的企业法人或其他组织被撤销、注销、吊销营业执照或者歇业、终止后既无财产可供执行，又无义务承受人，也没有能够依法追加变更执行主体的；
（七）依照刑法第五十三条规定免除罚金的；
（八）被执行人被人民裁定宣告破产的；
（九）行政执行标的灭失的；
（十）案件被上级人民裁定提级执行的；
（十一）案件被上级人民裁定指定由其他执行的；
（十二）按照《最高人民关于委托执行若干问题的规定》，办理了委托执行手续，且收到受托立案通知书的；
（十三）人民认为应当终结执行的其他情形。
前款除第（十）项、第（十一）项、第（十二）项规定的情形外，终结执行的，应当制作裁定书，送达当事人。