农村自建房会被执行。
依据我国相关法律的规定，农村自建房屋如果不是被执行人生活必需的房屋，人民是可以强制执行房屋的，一般会对房屋进行拍卖；对被执行人及其所扶养家属生活所必需的居住房屋，人民可以查封，但不得拍卖、变卖或者抵债。同时，在执行过程中应当留足被执行人及其近亲属的生活必须物品。如果农村唯一的住房被执行，可能会导致该农民永久地丧失宅基地使用权，因此对此类房屋应当慎重执行。农村宅基地本身作为集体用地，属于农民集体所有，农民个人只享受使用权，原则上不可以被执行、拍卖，但其上的住房可以依法执行。
农村自建房的产权问题：
1、农村自建房产权归属：通常农村自建房的产权归属于建房者或土地使用权持有者；
2、土地性质影响：农村自建房建设在集体土地上，其性质为集体所有；
3、房屋登记手续：农村自建房需办理房屋所有权证，以便于产权明晰和交易；
4、继承权问题：农村自建房可按照法律规定进行继承；
5、转让和交易：农村自建房的转让和交易受到一定的法律，通常只能在集体成员内部流转。
综上所述，根据我国相关法律规定，农村自建房屋在不是被执行人生活必需的情况下，可以强制执行并拍卖；但对被执行人及其所扶养家属生活所必需的居住房屋，可以查封但不得拍卖、变卖或者抵债。然而，如果农村唯一的住房被执行，可能会导致农民永久地丧失宅基地使用权，因此在执行此类房屋时应慎重考虑。农村宅基地本身属于农民集体所有，个人只享有使用权，原则上不可被执行或拍卖，但其上的住房可以依法执行。
【法律依据】：
《最高人民关于人民民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》
第六条
对被执行人及其所扶养家属生活所必需的居住房屋，人民可以查封，但不得拍卖、变卖或者抵债。
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