行政复议是上级行政机关对下级行政机关实行层级监督的一个法定手段，因此在确定行政复议机关时，原则上是以上一级行政机关管辖为原则，以原级管辖为例外。按照行政复议法律的规定，实践中，申请人可以依照以下规定来确定行政复议机关：
1.县级以上地方各级工作部门作为被申请人时，行政复议机关是该部门的本级或者是该部门的上一级主管部门。
《行政复议法》第十二条规定，对县级以上地方各级工作部门的具体行政行为不服的，由申请人选择，可以向该部门的本级申请行政复议，也可以向上一级主管部门申请行政复议。如此规定符合行政复议是行政机关内部自我纠正错误的一种监督制度的性质。根据和地方各级组织法的规定，县级以上地方各级领导所属各工作部门的工作。省、自治区、直辖市的各工作部门受统一领导，并且依照法律或者行规的规定受主管部门的业务指导或者领导。自治州、县、自治县、市、市辖区的各工作部门受统一领导，并且依照法律或者行规的规定受上级主管部门的业务指导或者领导。县级以上的地方各级有权改变或者撤销所属各工作部门的不适当的决定。因此，县级以上地方各级工作部门作为被申请人时，行政复议机关既可以是该部门的本级，也可以是该部门的上一级主管部门。至于最终由谁来履行对具体行政行为的行政复议职责，则应当由申请人选择，申请人向谁申请行政复议，就由谁受理该行政复议申请，并依法履行其行政复议职责，作出行政复议决定。
2.海关、金融、国税、外汇管理等实行垂直领导的行政机关和机关作为被申请人时，行政复议机关是其上一级主管部门。
海关、金融、国税、外汇管理等实行垂直领导的行政机关与一般的行政机关不同，只受其上级主管部门的领导，不受地方各级的领导。而行政复议作为行政机关内部自我纠正错误的一种监督制度，只有在有领导与被领导关系的行政机关，才会存在对具体行政行为进行行政复议的可能，上一级行政机关才有权撤销或者变更下一级行政机关的具体行政行为。因此，《行政复议法》第十二条第二款规定，对海关、金融、国税、外汇管理等实行垂直领导的行政机关的具体行政行为不服的，向上一级主管部门申请行政复议。即海关、金融、国税、外汇管理等实行垂直领导的行政机关作为被申请人时，其行政复议机关是上一级主管部门，申请人没有选择地方作为行政复议机关的权利。而机关也不同于一般的国家行政机关，这由其性质所决定的，其行政职权的行使通常涉及到国家秘密，因此，本条款规定，对机关的具体行政行为不服的，向其上一级主管部门申请行政复议。即机关作为被申请人时，其行政复议机关是其上一级主管部门，申请人也没有选择地方作为行政复议机关的权利。上述是行政复议机关的规定。
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