法律分析：当公司与员工之间发生工伤纠纷时，调解员应该遵循一定的程序和法律规定进行处理。首先，调解员应该通过调解的方式，尽力协商双方达成一致，避免案件进一步发展，减少因工伤纠纷造成的损失。其次，调解员应了解相关的法律法规，判断工伤纠纷的性质和责任，根据法律规定，确定赔偿标准和赔偿责任。
法律依据：
1.《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条：“用人单位违反本法规定，未履行安全保障义务或者违反、卫生标准造成职工工伤的，应当依照法律、行规的规定承担赔偿责任。”
2.《中华人民共和国劳动保障监察条例》第三十七条：“用人单位违反劳动安全卫生规定，致使劳动者发生工伤事故或者患职业病的，应当依法承担赔偿责任。”
3.《中华人民共和国侵权责任法》第三条：“单位或者个人因违法行为损害他人民事权益的，应当依照本法承担侵权责任。”
以上是调解员可以依据的法律依据，但具体的处理方式还需要结合案件情况进行分析和确定。
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