一、飞逝的埋启巨礁：自1866年起，海洋中出现了一个庞然大物，多艘航船因此神秘失踪。公众强烈要求清除这个水下巨礁。
二、赞成与反对：对于这个海洋怪物，有两种主要观点。一派认为它是一种强大的生物，另一派则认为它是一艘动力强大的潜水艇。法国巴黎自然史博物馆教授阿罗纳克斯认为，这个怪物是一种力量巨大的“独角鲸”。美国海军部组织了一艘名为亚伯拉罕·林肯号的快速驱逐舰，准备清除“怪物”。阿罗纳克斯教授应邀随行。
三、随先生尊便：阿罗纳克斯教授的仆人孔塞伊毫不犹豫地说：“随先生尊便。”他与阿罗纳克斯一同上了以法拉格特为舰长的驱逐舰。驱逐舰从布鲁克林码头扬帆起锚，向大西洋全速前进。
四、内德·兰德：舰长和全体海员同仇敌忾，决心捕获独角鲸。只有加拿大人捕鲸手内德·兰德对独角鲸的存在表示怀疑。
五、向冒险迎去：舰只在太平洋上游弋。大家的眼睛睁得大大的，努力观察海面。三个月过去了，海员们开始泄气，开始怀疑这次搜寻行动的意义。半年后，海员们要求返航。舰长许诺最后搜寻三天，三天后如果还无结果就将返回。到了规定期限的最后时刻，一向无动于衷的内德·兰德突然喊叫起来，他发现了怪物。
六、全速前进：林肯号企图捕获独角鲸，而独角鲸却若无其事地同林肯号捉迷藏。经过一夜一天的追逐周旋，到第二天晚上，双方形成对峙。当林肯号向独角鲸发起进攻时，独角鲸却突然熄灭电光，向林肯号喷射大水。林肯号遭遇了灭顶之灾。
七、不知其种属的鲸鱼：阿罗纳克斯教授被抛入海里，与孔塞伊在水中相依为命。正当筋疲力尽即将沉入海底时，被躲在独角鲸背上的内德·兰德拉出水面。内德说，这怪物不是鲸，是钢制的。阿罗纳克斯这才断定它是一艘潜水艇。我们在艇顶苟延残喘。天亮时，艇盖掀开，八个壮汉出来，把我们拖进艇里去。
八、动中之动：我们三人被关进一间黑屋子。半小时后，突然眼前一亮，进来两个人。我们用法语、英语、德语和拉丁文进行自我介绍，对方均无反应。他们走了，侍者送来食物，我们饱餐后就进入了梦乡。
九、内德·兰德的怒火：潜水艇浮出海面更换新鲜的空气。三人仍被关在铁屋子里，内德怒气冲天，他想逃跑，又想夺取这条艇。一个侍者进来时被他神液裂出其不意地在地掐得半死。这时候，一个说法语的人出现了。
十、海洋人：语的就是这艘鹦鹉螺号潜水艇上的尼摩（意为“不存在的人”）艇长。他说第一次见面保持沉默是为了了解我们，其实那四种语言他都听的懂。他要我们听从他的命令，否则将置我们于死地。尼摩艇长说，他们的衣食用都取自海洋，他热爱海洋，海洋中没有争斗、厮杀和。
十一、鹦鹉螺号：尼摩艇长带我们参观“鹦鹉螺号”上有一万两千册藏书的图书室，给我抽用海带制成的雪茄，观赏他收集的标本，又看了他为我准备的雅致的房间以及他自己住的简陋的房间。
十二、一切都用电：尼摩艇长给我们介绍房间里各种仪表的用途，如何开采海底矿藏，如游闭如何发电，如何提供空气，又介绍一只小艇的用途，还带我参观了厨房。
十三、几组数字：尼摩艇长向我们介绍潜水艇的概况、构造、动力、发光、建造过程等。
十四、黑潮：海底探险旅行正式开始。潜艇在海面以下五十米深处穿越黑水流。我和两位同伴尽情观赏形态美丽、活泼可爱的鱼儿。
十五、一封邀请信：尼摩艇长给我一封邀请信，请我到海底森林打猎。
十六、漫步海底平原：我和孔塞伊穿上防水衣服随尼摩艇长漫步海底平原，欣赏海洋奇物。
十七、海底森林：我们来到海底森林。仔细观察海底生物。还在海底睡了几个钟头。来到克雷斯波岛的海底绝壁，遇到巨形海蜘蛛，打到一只海獭，躲过了角鲨的侵袭。
十八、太平洋下四千米：潜艇在太平洋下穿行，令开眼界。一天，看到一条沉船，凄惨的海难情景令人惊悚。
十九、瓦尼可罗群岛：尼摩艇长从瓦尼可罗群岛海底遗物中揭开在十八世纪末两艘法国探险船只失踪的。
二十、托雷斯海峡：潜艇经由地球上最危险的海峡——托雷斯海峡前往印度洋，中途触礁搁浅。经艇长同意，我和两位同伴坐小艇上格波罗阿尔岛去。
二十一、陆上几日：我和两位伙伴一起上小岛采摘野果、狩猎，捉到一只被豆蔻汁给迷醉的极乐鸟。
二十二、尼摩艇长的闪电：土著的巴布亚人发现了我们，他们追赶到沙滩，后来还划来独木舟围住鹦鹉螺号，企图向我们发起进攻。尼摩艇长将电通到艇外壳，土著人触电后吓得魂飞魄散退走了。鹦鹉螺号被涨起来的海潮托起，离开了珊瑚石床，时间正如艇长所预料的分毫不差。
二十三、强制性睡眠：潜艇在印度洋行驶。尼摩艇长对不同深度的海水温度进行测量，发现水下一千米以下的海水是恒温的。我们目睹了有趣的一幕：海面上磷光闪烁，把大海照得如同白昼，原来是一些小水母球发光造成的。有一天，尼摩艇长突然下令将我们关起来，并强制我们睡眠。
二十四、珊瑚王国：第二天，艇长带我们来到五彩缤纷的珊瑚王国，把一位因伤而死的艇员安葬在珊瑚墓园里。
二十五、印度洋：鹦鹉螺号在印度洋穿行，我们看到了基灵岛，看到了“船蛸”，在孟加拉湾漂浮着无数的尸体，还看到了一望无际的“牛奶海”。
二十六、尼摩艇长的新建议：艇长给我们介绍原始的采珠法，采珠人悲惨的生活，建议我们参观锡兰岛的采珠场。
二十七、一颗价值千万的珍珠：艇长带我们观看一颗大如椰子的珍珠。一个采珠人正辛苦地采珠，突然一头大鲨鱼向他发起进攻，艇长舍身相救，与巨鲨展开殊死搏斗。正当艇长危在旦夕时，内德。兰德一叉刺中鲨鱼要害。艇长把采珠人救到小船上，并赠送一袋小珍珠。
二十八、红海：鹦鹉螺号在红海上劈波斩浪。尼摩艇长跟我介绍红海得名的原因和他发现从红海通往地中海的地下通道“阿拉伯隧道”的经过。
二十九、阿拉伯隧道：内德。兰德在红海上用捕鲸叉勇敢地击杀庞大的儒艮。尼摩艇长亲自指挥，潜水艇顺利穿过苏伊士地峡。
三十、希腊群岛：尼摩艇长把大量的黄金赠送给一个潜水员。鹦鹉螺号来到桑多林岛附近，我目睹了海底火山喷发的壮观奇景。
三十一、地中海上的四十八小时：鹦鹉螺号在地中海底穿行，我看到许多的遇难船只的残骸静卧在那里，惨不忍睹。
三十二、维哥湾：潜艇正沿着葡萄牙海岸行驶，内德·兰德做好了潜逃的准备，敦促我逃跑，我心里很矛盾，很不安。潜艇在维哥湾停了下来，艇长给我讲述一七0二年西班牙船只被英国海军战败沉没的历史，他命令艇员潜水搬取当年沉船上数不尽的金银珍宝。
三十三、失踪的：潜艇背向欧洲驶去，离越来越远，我们失去了一次逃跑的机会。尼摩艇长带我在夜间到三百米深的大西洋底去参观柏拉图笔下的大西洋城——亚特兰蒂斯。
三十四、海底煤矿：潜艇来到一个已经熄灭了的火山中心取燃料，我和同伴出去游览了一通。
三十五、马尾藻海：潜艇来到马尾藻海。下潜到海底一万六千米的深度竟安然无恙。
三十六、抹香鲸和长须鲸：鹦鹉螺号驶向南大西洋海域，海面上出现了一群长须鲸，捕鲸手内德。兰德向艇长请求让他去捕杀，却被艇长劝住了。艇长说

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