1、地势：日本在亚欧板块和太平洋板块的消亡边界上，是西太平洋岛弧与海岸山脉及海沟组合的一部分。日本百分之六十八的地域为山地。因平原较少，全国很多山上都种植农作物，最大的平原为关东平原；
2、地震带：日本在环太平洋火山地震带上，全球有十分之一的火山都在日本，在日本时常会发生火山活动。严重的地震则每一个世纪都会发生几次；近年发生的阪神大地震、新舄县中越地震都是里氏6级以上的强震，2011年3月11日本9.0级地震、海啸、核泄漏，受到世界各国关注。日本的温泉很多，并且已经发展成为旅游景点；
3、气候多样性：因为日本的岛屿呈北东向延伸得很长，南北跨越纬度约20度，因此有许多种气候类型。气候类型大部分是温带季风气候，南部的九州岛、四国、琉球群岛有副热带季风气候。北部的岛屿夏天温暖，冬天则十分漫长、寒冷，还时常有大量降雪。而中西部地区则冬天比较干燥，很少下雪，夏天潮湿。
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