仓管半年少了5万元货赔付如下：
1、劳动者故意造成的损失：需要100%全额赔偿用人单位，比如故意破坏用人单位的产品、设备等；并且用人单位依据《劳动合同法》第三十九条的规定，参照公司规章制度，可以不支付劳动者经济补偿。
2、劳动者存在重大过失的：需要赔偿用人单位50%左右的损失；明显可以避免的错误，比如因为违章操作给用人单位造成了经济损失的、喝酒后工作造成损失的，可以要求劳动者承担一半左右的损失；并且用人单位依据《劳动合同法》第三十九条的规定，参照公司规章制度，达到用人单位规章制度规定造成一定金额以上的损失的，可以不支付劳动者经济补偿。
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