1、做好审前准备工作。组织审计人员学习环境保规、有关环保知识和相关的环境监测技术等。
2、加强外部关系协调。加强与环保部门、环境监测单位、城建规划部门、技术监督部门、农业部门、土地资源管理部门、水资源管理部门、森林资源管理部门、卫生部门和有关部门的协作。
3、借助外力，外聘专家以解燃眉之急。专家库的建设和完善也是环境审计不断深化的重要保障。
4、加强理论研究。即加快环境审计立法，加快制定出台环境审计工作细则。
5、强化审计建议的建设性。注重对提高区域性环境治理项目绩效提出必要的建议，以帮助被审计单位改善工作，为决策提供参考依据，充分发挥环境绩效审计建议的建设性作用。
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