会计核算软件是专门用于会计核算工作的电子计算机应用软件，包括采用各种计算机语言编制的用于会计核算工作的计算机程序，从而替代人工，实现会计核算任务。会计核算系统是以事务处理功能为核心，包括多种功能的有机组合体。大部分的会计核算软件将会计核算系统按功能划分为若干个相对的子系统，使得系统每一部分的功能简单明了并相对，各子系统的会计信息相互传递与交流，形成完整的会计核算系统。
会计核算软件中具备相对地完成会计数据输入、处理和输出功能的各个部分，称之为会计核算软件的功能模块。会计核算软件的功能模块包括以下部分：
1. 事务处理模块：事务处理模块主要是以会计凭证为原始数据，按会计科目，统计指标体系对记凭证所载的经济内容，进行记录、分类、计算、加工、汇总，输出总分类、明细分类、日记及其他辅助簿、凭证和报表。事务处理模块主要包括：
- 事务初始（建）：根据程序要求和内部管理需要自定义会计科目体系、记凭证格式、簿体系的过程，相当于手工状态下设立一套新的务核算体系，是用计算机建的过程。
- 凭证处理（输入、修改、审核、汇总、打印）：包括凭证的输入、修改、审核、汇总、打印等内容。
- 查询：设定查询条件标志，灵活迅速查询某会计期间的会计凭证及有关明细分类、总的有关内容。
- 对功能：一部分是由会计核算软件在设计时由程序自动检查核对，如总、明细、日记之间的核对；另一部分则提供给用户进行核对，如与银行对单核对，与往来核对，与其他辅助核对等，并能做出调节表等相关资料。
- 结功能：按国家会计制度规定，按会计科目分级进行计算、汇总，结出借贷发生额和余额，结束当期核算，开始下一个会计核算循环。结还包括会计信息跨年度结转，开始一个新的会计年度的特殊内容。
- 打印输出功能：打印记凭证、簿等会计信息资料，以便用户使用和归档保管。
2. 报表处理模块：报表处理模块是按国家统一的会计制度规定，根据会计资料而编制会计报表，向公司管理者和部门提供财务报告。会计报表按其汇编范围可分为个别报表、汇总报表以及合并报表。报表处理模块包括：
- 报表定义：依据会计软件，建立一个新的报表体系所做的工作，包括定义报表名称，描述空白表格的格式，定义报表项目填写内容的清销数据来源和报表项目及运算关系，确定表格项目审核校验及报表间项目的勾稽关系，检查公式以及汇总报表的汇总范围等步骤。
- 报表计算、报表汇总、报表查询、报表输出：经过报表定义之后，就可以按规定计算或汇总产生所需要的会计报表，通过审核校验确认后，可以打印、复制、查询，输出会计报表。
3. 固定资产核算模块：固定资产核算模块主要是用于固定资产明细核算及管理。固定资产核算模块包括：
- 建立固定资产卡片：根据财务制度的规定，建立固定资产卡片，确定固定资产计提折旧的系数、方法。
- 建立固定资产账簿：录入固定资产变动情况，计提固定资产折旧，汇总计算固定资产原值、累计折旧及净值。
- 录入固定资产变动情况：按预先设计自动编制转分录，完成转的记录，打印输出固定资产明细和资料卡片，详细反映固定资产价值状况。
4. 工资核算模块：工资核算模块以计提发放职工个人工资的原始数据为基础，计算职工工资，处理工资核算。工资核算模块包括：
- 设计工资项目及项目计算公式：设计工资的项目及项目计算公式，录入职工工资基础资料，增减变动及修改。
- 计算汇总、查询、打印输出：计算配发不同面值的零、整钱数，定义工资计算公式（如代扣个人所得税计算公式）进行汇总计算，自动制作转凭证，填制分录，进行工资分配，计算工资福利费。
5. 其他模块：其他模块主要包括存货核算、成本核算系统、应收应付款核算、销售核算和财务分析等等。根据行业的特点，又有零售业进销存核算系统、批发业进销存核算系统等。根据管理的需要，又有劳资人事管理系统、国有资产管理系统等。

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