椎管内畸胎瘤在初期可能没有特定的临床表现，除非肿瘤增大或出现功能障碍，否则患者可能没有任何症状。然而，当症状出现时，它们通常包括腰背疼痛，这种疼痛可能表现为钝痛或剧烈的神经根性痛，影响腰腿的运动和感觉。此外，患者可能会经历双下肢的运动和感觉异常，以及反射变化，包括阳萎和膀胱与直肠括约肌的功能障碍。这些症状可能表明神经系统的损害，尤其是在脊髓下段、圆锥和马尾部区域的畸胎瘤。
约有80%的患者会遭受直肠和膀胱功能障碍，这可能表现为排尿和排便困难。在某些情况下，畸胎瘤可能会合并腰骶部脊柱裂，导致脊髓下端固定在较低位置，进一步加重运动系统的损害。如果畸胎瘤中包含皮毛窦，可能会引发颅内感染，或由于囊内容物的刺激引起发热等症状。畸胎瘤的诊断在现代医学技术的支持下变得相对容易，特别是通过磁共振成像（MRI）检查，能够精确地确定肿瘤的位置、大小和特征，以及其对邻近脊柱和脊髓的发育影响。
如果患者出现颅内炎症的表现，尤其是反复发作，或者腰背部有皮毛窦，那么畸胎瘤的可能性就很高。对于那些有腰背痛病史较长、年龄较轻，同时出现双下肢运动和感觉障碍及大小便功能不良的患者，应尽早进行胸腰骶椎的核磁共振检查，以便尽早诊断和治疗。MRI检查对于确定手术方案和预后判断至关重要。
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