数控铣床的数控系统具备多种刀具补偿功能，包括刀具半径补偿、夹角补偿和长度补偿等。
刀具半径补偿分为G41、G42、G40三种形式。其中，G41为刀具左补偿，G42为刀具右补偿，G40用于取消刀具半径补偿。刀具半径补偿值需预先存入存储器HXX中，程序执行时，系统会自动计算并进行补偿。需要注意的是，建立或取消刀补时，相关程序段必须使用G00或G01指令，而不能使用G02或G03。
刀具半径补偿有B功能和C功能两种形式。B功能补偿仅针对当前程序段进行，无法解决程序段之间的过渡问题，因此在某些情况下，需要将工件轮廓处理成圆角过渡，以确保工艺性。相比之下，C功能能够自动处理两程序段刀具中心轨迹的转接，使得可以完全按照工件轮廓进行编程。因此，现代CNC数控机床几乎都采用C功能刀具半径补偿。
夹角补偿（G39）主要用于解决两平面相交时产生的超程过切问题，导致加工误差。使用夹角补偿时需注意，此指令为非模态的，仅在指令的程序段内有效，并且只能在G41或G42指令之后使用。
刀具长度偏置（G43、G44）则可以用于补偿刀具长度的变化，而不必修改原有程序。补偿量存储在由H码指令指定的存储器中。G43表示补偿量与程序指令的终点坐标值相加，G44表示相减，取消刀具长度偏置则使用G49指令或H00指令。程序段N80 G43 Z56 H05中的05存储器中值为16，则终点坐标值为72mm。存储器中的补偿量数值，可以通过MDI预先存入存储器，或者使用程序段指令G10 P05 R16.0表示在05号存储器中的补偿量为16mm。
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