1. 农药使用差异：在生产加工过程中，有机食品坚决不使用农药、化肥、激素等人工合成物质，并且禁止采用基因工程技术。相反，其他食品在农药使用上没有如此严格的，允许有限使用这些物质，对于基因工程技术的使用也没有明确禁止。例如，绿色食品在基因工程技术和辐射技术的使用方面没有作出具体规定。
2. 土地转换期的差异：有机食品在土地生产转型方面设有严格的规定。由于某些物质可能在环境中残留较长时间，因此，土地从常规生产转换为有机食品生产需要经过两到三年的转换期。然而，生产绿色食品和无公害食品则没有这样的转换期要求。
3. 产量的差异：有机食品的生产在数量上受到严格控制，要求在特定的地块上以特定的产量进行生产。而生产其他食品则没有如此严格的规定。
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