黑头红臀鹎的公母可以通过外观、行为和性器官三个方面进行区分。
1. 外观：成年的黑头红臀鹎公鸟的喉部羽毛比母鸟更加黑色，翅膀则比母鸟长而尖，尾巴的羽毛也比母鸟更长。公鸟的羽毛颜色更加鲜艳，而母鸟的喉部羽毛为浅色，翅膀稍短，尾巴的羽毛也相对较短。
2. 行为：成年的黑头红臀鹎公鸟会出现摇头摆尾，呼啸等比较鲜明的叫声，以及飞行时翅膀的拍打频率更加明显，而母鸟则没有这种表现。
3. 性器官：黑头红臀鹎的性器官是硬的而突出的，位于肛门和腹部的中心位置上。通过观察性器官可以准确地区分公母。
需要注意的是，幼鸟的黑头红臀鹎外观上公母难以分辨，行为与成年的鸟类也有很大的区别，因此通过外观和行为区分公母的方法对幼鸟并不适用。最可靠的方法是通过性器官来区分黑头红臀鹎的公母。
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