不会清零。医保卡即使长时间不用，卡里的钱也是不会清零的。因为卡里的钱是属于职工个人的，即使不用，或者用不完，也会自动累积起来。在我国社会保险法里也有明确的规定，医保卡里面的钱不会清零，而可以累积计算，用来支付符合规定的医疗费用。
《中华人民共和国社会保险法》第十条，职工应当参加基本养老保险，由用人单位和职工共同缴纳基本养老保险费。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加基本养老保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加基本养老保险，由个人缴纳基本养老保险费。公务员和参照公务员法管理的工作人员养老保险的办法由规定。
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