1. 合同签订方差异：在事业单位聘任制下，合同签订方通常为事业单位或第三方派遣公司。通过聘用合同，事业单位与职工建立劳动关系。而正式职工通常与事业单位直接签订劳动合同，其工资和福利一般由财政拨款。
2. 工资与待遇区别：聘任制职工的工资通常由事业单位的预算外收入支付，依照合同约定的条款享受福利，待遇的变更需遵循法律规定。相比之下，正式职工的工资来源于财政拨款，并且享有法定的福利和待遇，这些通常不会因合同变更而改变。
3. 支付方式不同：聘任制员工的工资由事业单位直接支付，而正式职工的工资则由财政资金支持。这种差异反映了两者在事业单位中的不同地位和人事管理模式。
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