A、与豆科植物共生的根瘤菌，这种生物之间形成了共生关系。它们在根瘤中固定空气中的氮气，转变为植物能够吸收利用的含氮物质，而根瘤菌生活所需要的有机物是植物进行光合作用储存的有机物。二者相互依赖，共同生活，A不符合题意；
B、使小麦得叶锈病的真菌，这种生物通过寄生在小麦植株上，吸取养分来维持生活，属于寄生生活方式。B不符合题意；
C、健康人体肠道中的大肠杆菌，这种生物在人体肠道中帮助消化食物，同时人体为大肠杆菌提供生存的场所和营养物质，两者之间共生，但是大肠杆菌的生存方式不是共生的，而是寄生。C不符合题意；
D、冬虫夏草是一种真菌，它的生活方式可以是腐生或寄生。在适宜的环境下，冬虫夏草可以通过腐生方式获取营养，而在宿主昆虫体内，它通过寄生方式生长。D符合题意。
故选：D。
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