在综合工时制度下，工作时间通常设定为每日8小时，而超出这个时间的工作则按照1.5倍的加班费率计算。如果某一天加班时间达到12小时，同样也是按照1.5倍的加班费率来支付加班费。综合工时制度允许企业有一定的灵活性，只要员工在一个周期内工作时间达到166.6小时，公司可以不再安排加班。
加班费的计算公式为：当月工资除以当月标准工时，再乘以1.5倍，最后乘以加班小时数。例如，若某员工当月工资为1000元，加班12小时，则加班费计算方式为1000/166.6*1.5*12=108.04元。这个计算方法确保了员工在正常工作之外的额外劳动能够得到合理的补偿。
值得注意的是，尽管综合工时制度下员工可能无需每日或每周加班，但在特定时期内，企业仍可能安排加班以应对突发情况或特殊项目需求。在这种情况下，加班费的计算依然遵循上述标准，确保员工权益得到保障。
在实际操作中，企业应当详细记录员工的工时和加班情况，并及时支付相应的加班费用，以维护良好的劳动关系。员工也应当了解自己的权益，确保在综合工时制度下获得应有的报酬。
此外，不同地区和行业的具体规定可能有所不同，因此在应用综合工时制度时，企业应参考当地劳动法规，确保合法合规地安排员工的工作时间和加班。
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