在处理动物尸体时，必须遵循科学的方法以防止环境污染和疾病传播。对于因自然灾害或意外死亡的动物，应选择合适的地点进行掩埋。掩埋地点需远离水源、水井、水渠至少30米，与堤坝保持至少4.5米的距离，并且避免在水沟、峡谷、下水道或排水口附近。掩埋坑的大小需根据动物尸体的数量、类型和重量确定，通常不应小于动物总体积的两倍。若地质条件不允许在一个坑内掩埋，可在相隔至少1米的地方挖掘另一个掩埋点。死亡动物应在地面下1到2.5米的土层区域进行掩埋，覆盖土层厚度不少于1米，高出地面0.5米左右，并设置明确标识。
掩埋方式分为单独掩埋和集中掩埋。对于单独掩埋，小型宠物可采用约1米深度的浅坑，而大型动物如牛或马则需要2米宽、2.5米深的坑进行深层掩埋。在掩埋时，坑底应铺垫生石灰以消毒，使用漂白粉消毒尸体。漂白粉的使用量为每平方米20至40克，洒在动物尸体上，尸体分3至4层隔层掩埋，每层掩埋后铺上相同厚度的沙土。小动物掩埋后需覆盖0.3米以上的沙土，大动物单独一层掩埋需覆盖0.5米厚的沙土。掩埋坑深度不超过2.5米。
对于不能在72小时内清理或需运输处理的动物尸体，特别是湿热天气，应采取除臭、包装和运输措施。除臭可采用漂白粉、氢氧化钙和次氯酸钙的混合喷洒。包装时，尸体应用两层密封的包装袋，防止散臭和渗漏。运输时，新鲜尸体可直接装载，超过72小时未及时运载的尸体应包装后再运输。货车每次装载前和卸载后需进行严格消毒，确保行车路线由专业人员确定，避免病原传播。
在处理大量尸体时，工作人员需做好自身防护。接触尸体时应戴活性炭过滤的防毒口罩和手套，防止手部外伤。操作后及饭前必须洗手。进行尸体清理工作的人员需警惕厌氧创伤感染，必要时接种免疫血清。在掩埋过程中，人员入坑整理尸体时应警惕坍塌风险。
生石灰、漂白粉和漂粉精是常用的消毒药品。生石灰的使用方法是配制10%至20%的乳剂，即石灰乳，用于消毒。漂白粉为白色颗粒状粉末，主要成分为次氯酸钙，含有效氯25%左右。漂白粉可用于铺垫墓葬、地面消毒，其水溶液可用于餐具、饮水消毒，污水处理等。漂粉精是白色粉末，比漂白粉更易溶于水且稳定，用于消毒时需注意其对织物和金属制品的影响，操作时做好个人防护，保存在密闭容器内。详情
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