磷虾的消化系统相对简单，主要依赖于分枝的肝胰脏完成消化功能。其心脏呈多角形，具有三对心孔，血液循环方式为开放式。排泄器官为触角腺。磷虾的眼睛发达，眼柄较短，捕食性种类的眼睛角膜通常由大小不同的两片构成。大部分磷虾（除深磷虾属外）在眼柄上具有5到10个发光器，位于第2和第7对胸足基部，以及第1至第4对腹节腹甲。Stylochecion属的磷虾只在眼柄、第7对胸足和第1对腹节上具有5个发光器。这些发光器由发光细胞、反射器和晶体组成，并通过神经相互连接，不同种类的磷虾眼柄上的结构有所差异，它们能够发射蓝色的冷光。
磷虾是雌雄异体的生物，经历间接发育过程。精子被存放在精荚中。自由产卵的磷虾受精卵孵化后成为无节幼体，经过两次蜕皮后转变为后期的无节幼体；而抱卵种的磷虾在孵化时已经是后期无节幼体。后期无节幼体经过蜕皮进入节胸幼体阶段，并开始摄食，这个阶段分为三个阶段，第三阶段的节胸幼体蜕皮后成为带叉幼体，带叉幼体又分为四个阶段；最后发育为节鞭幼体，这个阶段的磷虾在形态上与成体相似，但体型较小且性成熟度不高，实际上属于幼后期。
磷虾的食性会随着年龄变化，幼体主要滤食硅藻和有机碎屑，而成体则捕食桡足类和其他小型浮游动物。滤食性磷虾通过胸肢上的刺毛构成过滤器进行滤食。当杂食性磷虾从滤食转变为捕食时，其过滤速率会显著下降。捕食性磷虾通常第二或第三对胸肢特别发达。磷虾的呼吸速率通常与其体表面积成比例。冷水性的磷虾具有较长的生命周期。例如，在鄂霍次克海，磷虾第一年生长迅速，之后生长速度逐渐放缓。磷虾的生长期与硅藻的春秋生长高峰是一致的，但在卵巢成熟时，生长几乎会暂停。磷虾的生殖量随年龄（体长）增加而增加，但达到一定年龄后，产卵量可能反而减少。不同种类的磷虾其发育速率不同，例如，挪威磷虾的无节幼体需3至4天发育，而拟缨磷虾则需7至9天，雌性南极大磷虾需25个月才能发育至性成熟（雄性需22个月）。
磷虾常常大量集群，并在水体中表现出昼夜垂直移动的习性，夜间会上升至水面，清晨则下降。详情
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